根据科技部党组的决定和科技部《关于印发〈关于落实科技部内设机构及职能调整工作的有关意见〉等文件的通知》（国科发人字[2006]145号）文件精神，农村中心承担农业科技成果转化资金（以下简称“转化资金”）项目组织实施工作中的过程管理工作。在科技部、财政部的领导下，在国务院涉农部门和各地方支持配合下，农业科技成果转化资金管理工作交接顺利完成，2006年度项目申报、受理、评审工作圆满结束。
　　1、为加强转化资金组织管理工作，农村司领导认真研究“十一五”转化资金管理工作思路，多次批示要求紧紧围绕社会主义新农村建设的战略需求，进一步明确分工、创新机制、完善制度，建立健全权责对应、分层管理、分工协作、有效监督并制约的工作机制;将项目组织、论证和推荐权利与责任更多地下放给地方科技厅（委、局）、财政厅（局）和部门科技司局，同时规范地方和部门的管理行为；加强部际和部内协调，实行宏观统筹、受理、审理、监理和监督、验收、评价有机衔接的链式管理。
　　2、为做好转化资金组织实施工作，农村中心领导班子高度重视、多次专题听取农转资金交接进展和工作汇报，积极研究工作思路，多次主动与创新基金管理中心会商，顺利、平稳完成了项目数据库、管理系统、档案管理三大块工作的交接。
　　3、为做好2006年度转化资金项目申报、受理和评审工作，确保转化资金公正、公平、透明、规范管理，农村中心组织开发了转化资金项目网络化申报受理与评审两个工作平台，初步实现开放式、属地化、集成化管理。
　　4、7月4日，科技部农村司在广西南宁组织召开2006年度转化资金工作通气会，会议通报了科技部内设机构职能调整情况、2006年项目指南编制和2003年以来转化资金的监理验收情况，提出了转化资金管理工作思路和重点工作，介绍了转化资金项目网络申报系统。会议还围绕转化资金的分层级责权管理、转化资金项目的定位、规范管理等议题开展充分讨论。
　　5、为做好今年项目评审工作，建立了专家推荐标准，公开向46家推荐单位征集技术、经济和财务领域评审专家，有效专家数量从580名增加到1080名，专家库结构得到合理调整和优化，专家数据库实现数字化管理，为2006年评审专家的遴选、回避机制打下了良好基础。
　　6、6月20日-7月25日，根据2006年度转化资金项目指南要求，科研院所、大专院校、科技型企业在网上公开申报项目，合计1524项。46家推荐单位对申报项目进行筛选、论证后，按照科技部、财政部下达的指标限额，在网上向农村中心共推荐项目603项，项目推荐筛选比例为2.5:1。农村中心共受理项目603项，同时依据《项目指南》要求和新制订的《形式审查规范》，对推荐项目的纸质材料和电子文本进行了严格的形式审查。今年首次直接面向社会和项目申报单位开展申报工作，首次实现网络化申报与管理。
　　7、8月16-18日，2006年度农业科技成果转化资金项目专家评审会在北京召开，专家恪尽职守、高度负责、认真细致、严谨求实和客观公正地对转化资金项目进行了评审，项目评审工作顺利结束。今年转化资金项目专家评审成功实行了“网上审阅+会议评审”相结合、以会议评审为主的方式，向网络化评审迈出了重要的一步。
　　通过过去五年转化资金项目的实施，已初步形成了从中央到地方都非常重视农业科技成果转化的良好局面。国家财政设立转化资金有力带动了地方财政、企业、大专院校、科研院所对农业科技成果转化工作的资金投入，有力地促进了我国农业经济的发展，是新阶段加强农业科技成果转化工作、完善农业科技工作布局的重要举措，也是推进农业和农村经济结构调整、促进农民增收的有效途径。